Solid Tumors
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- del(19q)
- inv(1)(q21q23) TPM3/NTRK1
- t(1;1)(p36;p36) RERE/SLC2A5
- t(1;1)(p36;p36) UBR4/ATP13A2
- t(1;1)(p36;p34) RLF/FAM132A
- t(1;1)(p36;p36) PRKCZ/SKI
- inv(2)(p23q35) ATIC/ALK
- del(8)(q12q24) HAS2/PLAG1
- t(1;2)(q21;p23) TPM3/ALK
- t(1;1)(p34;q44) SMYD3/ELOVL1
- t(1;3)(p36;q25) WWTR1/CAMTA1
- inv(1)(q23q31) TPR/NTRK1
- del(1)(p36p36) RERE/PIK3CD
- del(8)(q13q21) HEY1/NCOA2
- t(1;1)(q21;q21) GATAD2B/PRKAB2
- t(1;2)(p35;q37) ZBTB8B/TRAF3IP1
- t(1;2)(p12;p16) REL/MAN1A2
- t(1;1)(p36;p34) ARHGEF16/TCTEX1D4
- del(11)(p15p15) PIK3C2A/TEAD1
- t(1;2)(p12;p15) PHGDH/WDPCP
- t(1;3)(p34;q26) ATP11B/POU3F1
- t(1;10)(p22;q24) FGF8
- t(1;3)(p34;q26) OSCP1/SOX2-OT
- t(1;3)(p33;q29) TFRC/NSUN4
- t(1;1)(p36;p34) RLF/UBE2J2
- t(1;4)(p31;q22) BMPR1B/ALG6
- t(1;13)(p36;q14) PAX7/FOXO1
- t(1;13)(p36;q14) PAX7/FOXO1
- inv(12)(q13q13) NAB2/STAT6
- t(1;13)(p36;q14) PAX7/FOXO1
- t(1;5)(p34;q31) CTNNA1/HEYL
- t(1;17)(p34;p13) THRAP3/USP6
- t(1;5)(q25;p13) DARS2/ZFR
- t(1;1)(p35;p35) SRSF4/SNRNP40
- t(1;1)(p35;p35) SERINC2/ZCCHC17
- inv(1)(p34p34) BMP8B/RLF
- t(1;8)(p36;q21) SLC7A13/WDTC1
- t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1
- inv(2)(p21p23) EML4/ALK
- t(1;1)(p34;p32) FGGY/TESK2
- t(1;2)(q25;p23) TPM3/ALK
- t(2;2)(p23;q13) RANBP2/ALK
- t(2;2)(p23;q36) PAX3/NCOA1
- t(1;1)(p13;p12) IGSF3/MAN1A2
- t(1;8)(p32;q24) NRD1/KCNK9
- t(1;1)(p13;p12) VANGL1/HAO2
- t(1;9)(p33;p13) KIF24/FAAH
- t(1;10)(p32;q21) CDK1/USP24
- inv(1)(p34p34) CAP1/BMP8B
- t(1;10)(p31;p14) SFMBT2/PRKACB
- inv(1)(p34p34) RLF/PPT1
- t(1;10)(q32;q22) TMEM206/PSAP
- del(16)(q24q24) USP10/ZDHHC7
- t(1;1)(q24;q24) CD247/GPR161
- t(1;6)(p32;q14) ZFYVE9/CGA
- t(1;6)(q21;q22) TPM3/ROS1
- t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
- t(2;11)(q37;q13)
- t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
- t(1;1)(p34;p34) CAP1/MACF1
- t(2;13)(q35;q14) PAX3/FOXO1
- t(2;13)(q35;q14) PAX3/FOXO1
- inv(2)(p23q35) ATIC/ALK
- t(2;13)(q35;q14) PAX3/FOXO1
- t(1;19)(q23;p13) TCF3/PBX1
- t(1;11)(p31;q24) ETS1/NEGR1
- t(2;12)(p23;p11) PPFIBP1/ALK
- inv(22)(q12q12) EWSR1/PATZ1
- t(2;17)(p23;q23) CLTC/ALK
- t(1;12)(q25;p12) HMCN1/ETNK1
- t(1;16)(q21;p12) CCP110/GOLPH3L
- t(2;17)(p23;q23) CLTC/ALK
- inv(X)(p11p11) BCOR/CCNB3
- t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
- t(2;2)(p23;p22) STRN/ALK
- t(1;10)(p22;q24) FGF8
- t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3
- t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
- t(1;17)(p21;q25) UNK/DPYD
- t(1;1)(p34;p34) INPP5B/SF3A3
- inv(2)(p21p23) EML4/ALK
- t(1;1)(p34;p34) RLF/MYCL
- t(1;17)(p12;q11) ALDOC/MAN1A2
- t(1;21)(p35;q22) ITSN1/MATN1
- del(2)(p21p23) EML4/ALK
- t(1;1)(q32;q32) SLC45A3/ELK4
- t(2;2)(p25;p25) ROCK2/SH3YL1
- inv(1)(p34p34) RLF/MYCL
- t(2;2)(p24;p23) GPN1/KLHL29
- t(3;12)(q27;q15) HMGA2/LPP
- t(1;12)(p32;q14) PPAP2B/HMGA2
- t(1;12)(p32;q14) PPAP2B/HMGA2
- t(1;1)(p34;p34) RLF/COL9A2
- inv(2)(p21p23) EML4/ALK
- t(1;1)(p34;p34) RLF/SMAP2
- t(3;17)(q21;p13) CNBP/USP6
- t(1;1)(p34;p34) SF3A3/GNL2
- del(2)(p21p23) EML4/ALK
- t(2;2)(p21;p21) THADA/EML4
- t(2;2)(p16;p23) PSME4/PPP1CB
- t(1;21)(q32;q22) SLC45A3/ERG
- t(2;2)(p15;p15) EHBP1/FAM161A
- t(2;2)(q21;q21) GPR39/MGAT5
- t(2;2)(q21;q24) ACVR1C/MGAT5
- t(2;2)(q23;q35) TNS1/RPRM
- t(2;2)(p22;p21) MAP4K3/PRKCE
- t(2;3)(p16;q26) KCNMB2/NRXN1
- t(2;4)(p16;q13) BCL11A/EPHA5
- t(2;5)(p16;p15) NRXN1/PLEKHG4B
- t(2;5)(p11;p12) HCN1/FUNDC2P2
- t(2;2)(q21;q22) MGAT5/HNMT
- t(4;19)(q35;q13) CIC-DUX4
- t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4
- t(2;2)(q24;q24) STK39/B3GALT1
- t(1;1)(p34;p34) SMAP2/MYCL
- t(2;5)(q35;p13) USP37/OSMR
- t(2;2)(q33;q33) ADAM23/SGOL2
- t(2;6)(p24;p22) ID4/FAM84A
- t(5;8)(p15;q13) AHRR/NCOA2
- t(2;3)(p23;q12) TFG/ALK
- t(2;16)(q24;q11) ANKRD26P1/SLC4A10
- t(2;8)(p11;p21) SFTPB/DPYSL2
- t(2;17)(p25;q21) CRHR1-IT1/ALLC
- t(2;9)(p23;q31) ALK/PTPN3
- t(2;18)(p24;q11) KLHL29/PSMA8
- inv(6)(p13q25)
- t(12;14)(q14;q11) HMGA2/CCNB1IP1
- t(1;1)(p34;p34) ZMPSTE24/MFSD2A
- t(2;10)(p23;p11) KIF5B/ALK
- t(2;22)(p12;q12) EVA1A/TTC28
- t(2;10)(p11;q22) SFTPA2/SFTPB
- t(1;1)(q21;q21) TXNIP/NOTCH2NL
- t(6;9)(q23;p23) MYB/NFIB
- t(2;14)(p23;q32) KLC1/ALK
- t(6;11)(p21;q12) TFEB truncated
- t(6;12)(q22;q14.1) LRIG3/ROS1
- t(2;19)(q11;q13) XRCC1/MAL
- t(3;3)(p12;q29) PAK2/VGLL3
- t(3;3)(q11;q13) ALCAM/EPHA6
- t(3;3)(q12;q13) GSK3B/IMPG2
- t(3;3)(p25;p25) TTLL3/MTMR14
- t(1;1)(q25;q25) XPR1/TRMT1L
- t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
- t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
- t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
- t(12;14)(q14;q24) HMGA2/RAD51B
- inv(7)(q21q34) AKAP9/BRAF
- del(1)(q44q44) ZNF695/TFB2M
- t(1;3)(q32;q27) SLC45A3/ETV5
- t(3;3)(q13;q22) SLCO2A1/GUCA1C
- del(8)(q12q24) HAS2/PLAG1
- t(1;13)(p36;q14) PAX7/FOXO1
- t(3;3)(q21;q22) RUVBL1/TMCC1
- t(3;3)(q22;q22) PIK3CB/BFSP2
- t(11;12)(q23;q15) HMGA2
- t(7;12)(p22;q13) ACTB/GLI1
- t(1;7) (q32;q34) SLC45A3/BRAF
- t(1;7)(q32;p21) SLC45A3/ETV1
- t(11;16)(p11;p11) FUS/CREB3L1
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
- t(12;16)(q24;q24) ZDHHC7/ABCB9
- inv(22)(q12q12) EWSR1/PATZ1
- t(13;13)(q12;q14) DLEU2/PSPC1
- t(1;2)(p13;q35) CSF1/COL6A3
- t(7;8)(q31;q12) COL1A2/PLAG1
- inv(8)(q12q12) CHCHD7/PLAG1
- ins(8)(q12;q11q11) TCEA1/PLAG1
- t(1;2)(q25;p23) TPM3/ALK
- t(1;12)(p34;q24) TRIT1/EP400
- t(3;3)(q22;q22) TMCC1/C3orf36
- t(3;3)(q24;q26) HLTF/OTOL1
- t(3;3)(q25;q25) GMPS/C3orf55
- t(3;3)(q25;q26) IQCJ/BCHE
- t(7;12)(q22;q13-14) HMGA2
- t(1;19)(p36;q13) UBE4B/TBCB
- t(3;3)(q25;q27) PPM1L/MCF2L2
- t(3;3)(q25;q28) PYDC2/C3orf79
- t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/BMP8B
- t(8;21)(q24;q22) NDRG1/ERG
- t(3;3)(q26;q26) ATP11B/SI
- t(3;3)(p24;p24) EOMES/SLC4A7
- t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/DEM1
- t(3;3)(q26;q26) PHC3/FNDC3B
- t(3;3)(p21;p14) CACNA2D3/FLNB
- t(3;9)(q12;q22) TFG/NR4A3
- t(1;22)(p36;q11) SMARCB1/WASF2
- t(9;15)(q22;q21) TCF12/NR4A3
- t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1
- t(9;17)(q22;p13) OMD/USP6
- t(3;3)(q26;q27) CCDC39/MCF2L2
- t(9;17)(q22;q11) AF15/NR4A3
- t(1;3)(p36;q25) WWTR1/CAMTA1
- inv(X)(p11q12) NONO/TFE3
- t(X;1)(p11;p34) SFPQ/TFE3
- t(X;1)(p11;q21) PRCC/TFE3
- t(X;6)(q13;q22) COL4A5 and COL12A1
- t(X;17)(p11;q25) ASPSCR1/TFE3
- t(X;17)(p11;q25) ASPSCR1/TFE3
- t(X;17)(p11;q23) CLTC/TFE3
- t(X;18)(p11;q11) SS18/
- t(X;18)(p11;q11) SS18/
- t(X;20)(p11;q13) SS18L1/SSX1
- inv(10)(q11q11) RET/NCOA4
- inv(10)(q11q11) NCOA4/RET
- t(3;3)(q21;q22) MGLL/SLCO2A1
- t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/RIMS3
- t(3;3)(q26;q28) SOX2/TPRG1
- t(3;3)(q27;q28) LPP/ST6GAL1
- t(3;3)(q25;q25) CP/WWTR1
- inv(10)(q11q21) CCDC6/RET
- t(10;17)(q22;p13) YWHAE/NUTM2E
- t(3;3)(q27;q29) EHHADH/SENP5
- t(3;6)(p24;q16) UBE2E1/ASCC3
- t(3;3)(q29;q29) LRCH3/MIR570
- t(4;6)(p15;q22) SLC34A2/ROS1
- t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/RLF
- t(3;4)(q26;p16) ATP11B/ZNF595
- t(8;12)(p12;q15) HMGA2
- t(3;8)(q27;q22) MCF2L2/MIR548A3
- t(4;12)(q12;q12) SCAF11/PDGFRA
- t(5;5)(q12;q12) ERBB2IP/MAST4
- t(11;16)(q13;p13) C11orf95/MKL2
- t(2;12)(q37;q14) HMGA2/ACKR3
- t(1;5)(q42;q32) IRF2BP2/CDX1
- t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
- t(11;19)(q11;q13) MALAT1
- t(5;5)(q13;q13) ARHGEF28/UTP15
- t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
- t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
- t(11;12)(q23;q15) HMGA2
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
- t(6;10)(p21;q22) HMGA1
- t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/ZNF643
- t(5;5)(q31;q31) UBE2D2/MATR3
- t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/ZNF684
- t(12;13)(q14;q13) HMGA2/LHFP
- t(12;14)(q15;q24) HMGA2
- t(6;14)(p21;q24) HMGA1
- t(6;9)(q23;p24) MYB/NFIB
- t(12;15)(p13;q25) ETV6/NTRK3
- t(11;16)(p11;p11) FUS/CREB3L1
- t(12;16)(q13;p11) FUS/ATF1
- t(12;16)(q13;p11) FUS/DDIT3
- t(12;16)(q13;p11) FUS/DDIT3
- t(11;16)(q13;p13) C11orf95/MKL2
- t(5;6)(q11;p22) IL6ST/KDM1B
- t(5;6)(q33;q22) CD74/ROS1
- t(3;8)(q29;p12) FYTTD1/WRN
- t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
- t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
- t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
- t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
- t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
- t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
- t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
- t(3;11)(q26;p15) PDE3B/ATP11B
- t(3;13)(q21;q33) TNFSF13B/MYLK
- t(1;20)(p34;q11) PPT1/BCL2L1
- t(3;17)(q25;p11) MAP2K3/SSR3
- t(1;20)(p34;q11) RLF/HM13
- t(5;6)(q33;q22) ROS1/CD74
- t(14;22)(q32;q12) EWSR1/YY1
- t(5;8)(p15;q22) CMBL/NDUFAF6
- t(2;5)(p22;q14) BIRC6/BHMT2
- t(15;19)(q14;p13) BRD4/NUTM1
- t(5;10)(q35;q11) SGMS1/STK10
- t(1;17)(p34;p13) THRAP3/USP6
- t(5;12)(q33;q14) GRIP1/TNIP1
- t(2;6)(q31;p12) RCAN2/RAPGEF4
- t(3;17)(q29;q23) MIR21/WDR53
- t(16;17)(q22;p13) CDH11/USP6
- t(16;21)(p11;q22) FUS/ERG
- t(3;19)(q27;q13) ACTN4/IGF2BP2
- t(16;17)(q22;p13) CDH11/USP6
- t(16;21)(q13;q22) HERPUD1/ERG
- t(17;17)(p13;q21) COL1A1/USP6
- t(6;6)(q22;q22) GOPC/ROS1
- t(2;12)(p23;p13) CACNA2D4/WDR43
- t(3;20)(q21;q13) SLC12A8/BCAS1
- t(17;17)(q21;q24) DDX5/ETV4
- t(17;17)(q25;q21) CANT1/ETV4
- t(6;6)(q22;q22) TPD52L1/TRMT11
- t(17;22)(q22;q13) COL1A1-PDGFB
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
- inv(6)(q22q25) EZR/ROS1
- t(3;3)(p21;p21) NEK4/SFMBT1
- t(6;7)(q22;p22) KDELR2/GOPC
- t(3;21)(p11;q21) POU1F1/TMPRSS15
- del(1p)
- t(3;3)(p21;q23) RASA2/NICN1
- t(6;7)(q22;p22) KDELR2/ROS1
- t(3;3)(q13;q22) STAG1/STXBP5L
- t(3;22)(q26;q11) ATP11B/TPTEP1
- del(4)(p16p16) FGFR3/TACC3
- t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444
- t(4;4)(q13;q22) CCSER1/UGT2A1
- del(3)(q23q23) SPSB4/ACPL2
- t(4;6)(p15;q22) SLC34A2/ROS1
- t(4;8)(q13;q24) COX18/ZFAT
- t(16;21)(p11;q22) FUS/ERG
- t(12;13)(q14;q13) HMGA2/LHFP
- del(22)(q13)
- t(12;15)(p13;q26) ETV6/NTRK3
- t(3;3)(q23;q24) SLC25A36/PLSCR1
- t(4;9)(q13;q32) ADAMTS3/SNX30
- t(12;15)(p13;q25) ETV6/NTRK3
- t(3;9)(q12;q22) TFG/NR4A3
- t(X;1)(p11;q21) PRCC/TFE3
- t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1
- t(X;1)(q23;q24) ACSL4/DCAF6
- t(12;16)(q13;p11) FUS/ATF1
- t(12;16)(q13;p11) FUS/DDIT3
- t(X;20)(p11;p12) SPTLC3/MAOA
- inv(X)(p11p11) BCOR/CCNB3
- t(X;X)(p22;q13) EDA/MID1
- inv(X)(p11.4p11.22) BCOR/CCNB3 in bone sarcoma
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 in giant cell tumour of bone
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 in rhabdomyosarcomas
- t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 in solid pseudopapillary tumour of the pancreas
- t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1 in angiomatoid fibrous histiocytoma
- t(16;21)(p11;q22) FUS/ERG
- t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444 in myoepithelial carcinoma
- t(1;2)(q21;p23) TPM3/ALK
- t(1;22)(q23;q12) in myoepithelioma
- t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
- t(2;17)(p23;q23) CLTC/ALK
- t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
- t(2;2)(p23;q13) EWSR1/PBX1
- t(2;2)(p23;q35) PAX3/NCOA1 in alveolar rhabdomyosarcoma
- t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3 in a small round cell tumour
- t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1 in angiomatoid fibrous histiocytoma
- t(4;19)(q35;q13) in pediatric undifferentiated soft tissue sarcomas
- t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4 in embryonal rhabdomyosarcoma (ERMS)
- t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 in hidradenoma of the skin
- t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 in mucoepidermoid carcinoma of the salivary glands
- t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 in undifferentiated sarcoma
- t(8;21)(q24;q22) NDRG1/ERG in prostate cancer
- Thyroid: Papillary Carcinoma with inv(7)(q21q34) AKAP9/BRAF
- Subungual exostosis with t(X;6)(q13;q22)
- Soft tissue tumors: t(1;13)(p36;q14) PAX7/FOXO1 in alveolar rhabdomyosarcoma
- Soft tissue tumors: t(2;13)(q35;q14) PAX3/FOXO1 in alveolar rhabdomyosarcoma
- Soft tissue tumors: Synovial sarcoma: t(X;18)(p11;q11) SS18/
- Soft tissue tumors: Alveolar soft part sarcoma: t(X;17)(p11;q25) ASPSCR1/TFE3
- Soft Tissue Tumors: t(X;20)(p11;q13) SS18L1/SSX1 in Biphasic Synovial Sarcoma
- Soft tissue chondroma with t(3;12)(q27;q15) HMGA2/LPP
- Pericytoma with t(7;12)(p22;q13) ACTB/GLI1
- Ovary: inv(10)(q11q11) RET/NCOA )in ovarian germ cell tumors
- Myxoinflammatory fibroblastic sarcoma with t(1;10)(p22;q24) FGF8
- Lung: t(6;12)(q22;q14.1) LRIG3/ROS1 in lung adenocarcinoma
- Lung: inv(2)(p21p23) EML4/ALK in non-small cell carcinoma
- Liver: t(11;19)(q11;q13) MALAT1 in Mesenchymal Hamartoma of the Liver
- Kidney: inv(X)(p11q12) NONO/TFE3 in renal cell carcinoma
- Kidney: t(10;17)(q22;p13) YWHAE/NUTM2E in Clear Cell Sarcoma of the Kidney
- Kidney: t(6;11)(p21;q12) in renal cell carcinoma
- Kidney: t(X;1)(p11;p34) SFPQ/TFE3 in renal cell carcinoma
- Kidney: t(X;1)(p11;q21) PRCC/TFE3 in renal cell carcinoma
- Kidney: t(X;17)(p11;q23) CLTC/TFE3 in renal cell carcinoma
- Kidney: Primary renal t(X;17)(p11;q25) ASPSCR1/TFE3 tumor
- Head and Neck: Pleomorphic salivary gland adenoma with ins(8)(q12;q11q11) TCEA1/PLAG1
- Head and Neck: Pleomorphic salivary gland adenoma with inv(8)(q12q12) CHCHD7/PLAG1
- Carcinoma with t(15;19)(q14;p13) BRD4/NUTM1
- Bone: t(16;17)(q22;p13) CDH11/USP6 in aneurysmal bone cyst
- Bone: t(17;17)(p13;q21) COL1A1/USP6 in aneurysmal bone cyst
- Bone: t(1;17)(p34;p13) THRAP3/USP6 in aneurysmal bone cyst
- Bone: t(3;17)(q21;p13) CNBP/USP6 in aneurysmal bone cyst
- Bone: t(9;17)(q22;p13) OMD/USP6 in aneurysmal bone cyst