Difference between revisions of "Translocations et al. in Hematological Cancers"

From Compendium of Cancer Genome Aberrations
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==Translocations==
  
 
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{| class="wikitable"
 
|+Translocations
 
|+Translocations
 
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|'''Anomaly'''
+
|'''ANOMALY'''
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|'''Associated Disorders'''
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|'''ASSOCIATED DISORDERS with FISH test'''
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|'''GENES'''
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|[[t(1;5)(q22;q33)]]
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|[[MPD with eosinophilia]],[[ CEL]],[[ B-ALL]]
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|[[PDE4DIP-PDGFRB]]
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|-
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|[[der(1;7)(q10;p10)]]
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|[[t(1;14)(q21;q32)  A B C D]]
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|-
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|-
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|[[t(3;3)(q21;q26.2) ]]
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|[[RPN1-MECOM(EVI1)]]
 
|-
 
|-
−
|Bread
+
|[[t(3;5)(p21-25;q32-35)]]
−
|Pie
+
|[[MPD]]
 +
|[[GOLGA4-PDGFRB ]]
 
|-
 
|-
−
|Butter
+
|[[t(3;21)(q26.2;q22)  A ]]
−
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+
|[[ t-AML]],[[ t-MDS]]
 +
|[[RPL22(EAP)-RUNX1(AML1)]]
 
|-
 
|-
−
|der(1)t(1;1)(p36;q21)
+
|[[t(4;11)(q21;q23)]]
−
|[[NHL]],MDS
+
|[[B-ALL]],[[ T-ALL]]
 +
|[[AFF1(AF4)-MLL]]
 +
|-
 +
|[[t(4;14)(p16.3;q32)]]
 +
|[[MM]]
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|-
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|[[t(4;22)(q12;q11)]]
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 +
|[[ PDGFRA -BCR]]
 +
|-
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|[[t(4;5;5)(q23;q31;q33)]]
 +
|[[chronic basophilic leukemia]]
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|-
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 +
|[[CMML]]
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|-
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 +
|[[atypical MPD]]
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|-
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 +
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|[[ETV6(TEL)-ACSL6 ]]
 +
|-
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|[[t(5;12)(q33;q24)]]
 +
|[[MPD with eosinophilia  ]]
 +
|[[GIT2-PDGFRB]]
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|-
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|[[t(5;12)(q33;p13)]]
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|-
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|-
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|-
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|[[TP53BP1-PDGFRB]]
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|-
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|[[t(5;14)(q35;q32)]]
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 +
|-
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|-
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|[[der(5;17)(p10;q10)]]
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|[[MDS]],[[ AML]]
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|[[NPM1(NPM)-RARA]]
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|-
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|[[t(5;17)(q33;p11.2)]]
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|[[JMML ]]
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|[[SPECC1-PDGFRB]]
 +
|-
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|[[t(5;17)(q33;p13)]]
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|[[CMML]],[[ atypical MPD]]
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|[[RABEP1-PDGFRB ]]
 +
|-
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|[[der(6)t(1;6)(q21;p21.3)]]
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|[[PMF]]
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|-
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|[[t(6;9)(p23;q34) ]]
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|[[MDS]],[[ AML]]
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 +
|-
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|[[t(6;11)(q27;q23) ]]
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|[[MLLT4(AF6)-MLL]]
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|-
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|[[t(7;11)(p15;p15)]]
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|[[AML]]
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|[[NUP98-HOXA9]]
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|[[t(8;14)(q24.1;q32) ]]
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|[[MYC(C-MYC)- IGH]]
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|-
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|[[t(8;16)(p11.2;p13.3)  A]]
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|[[KAT6A(MYST3)-CREBBP(CBP)]]
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|[[t(8;21)(q22;q22) A ]]
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|[[AML M2 mostly]],[[ rarely M1]],[[ M4]]
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|[[RUNX1(AML)-RUNX1T1(ETO)]]
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|-
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|[[t(8;22)(q24.1;q11.2) ]]
 +
|[[BL]],[[ B-ALL]],[[ NHL]],[[ MM]]
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|[[MYC(C-MYC)-IGL(IGL)]]
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|-
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|[[add(9)(p24)]]
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|[[JAK2]]
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|-
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|[[t(9;11)(p22;q23)]]
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 +
|-
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|[[PAX5-IGH]]
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|-
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|[[t(9;22)(q34;q11.2) A B ]]
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|[[CML]],[[ B-ALL]],[[  T-ALL]]
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|[[ABL1(ABL)-BCR]]
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|-
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|[[t(11;14)(q13;q32) A ]]
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|[[MCL]],[[ MM]]
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|-
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|[[t(11;14)(q23;q32)]]
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|-
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|[[t(11;16)(q23;p13.3)]]
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|[[t-MDS]],[[ t-AML]]
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|[[MLL-CREBBP(CBP)]]
 +
|-
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|[[t(11;17)(q23;q21)]]
 +
|[[APL]]
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|-
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|[[t(11;18)(q21;q21)]]
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|[[MALT]]
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|[[BIRC3(API2)-MALT1]]
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|-
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|[[t(11;19)(q23;p13.1) ]]
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|[[AML]]
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|[[MLL-ELL]]
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|-
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|[[t(11;19)(q23;p13.3) ]]
 +
|[[B-ALL]],[[ AML]],[[ T-ALL]]
 +
|[[MLL-MLLT1(ENL)]]
 +
|-
 +
|[[t(14;16)(q32;q23)]]
 +
|[[MM]]
 +
|[[IGH-MAF]]
 +
|-
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|[[t(14;18)(q32;q21) ]]
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|[[BL]],[[ DLBCL]],[[ FL]],[[ CLL]]
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|[[IGH-BCL2]]
 +
|-
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|[[t(14;19)(q32;q13.3)]]
 +
|[[CLL]],[[ DLBCL]],[[ MCL]],[[ MZL]],[[ SLVL]]
 +
|-
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|[[t(14;22)(q32;q11.2)]]
 +
|[[B-ALL]],[[ CLL]],[[ HCL]],[[ AML]],[[ NHL]],[[ DLBCL]]
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|[[IGH-IGL]]
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|-
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|[[t(15;17)(q24;q21)]]
 +
|[[APL]]
 +
|[[PML-RARA]]
 +
|-
 +
|[[t(16;16)(p13.1;q22) ]]
 +
|[[AML M4Eo]]
 +
|[[MYH11-CBFB]]
 +
|-
 +
|[[der(19)t(1;19)(q23;p13.3)]]
 +
|[[B-ALL]],[[ L3-like ALL]],[[ T-ALL]],[[ NHL]],[[ AML]]
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|[[PBX1-TCF3(E2A)]]
 +
|-
 +
|[[der(Y)t(Y;1)(q12;q12) ]]
 +
|[[MDS]]
  
 
|}
 
|}
  
−
==Myelodysplastic Syndromes (MDS)==
 
  
−
: [[+11 or trisomy 11 (solely) KMT2A]]
+
==Inversions==
−
: [[+13 or trisomy 13]]
 
−
: [[+14 or trisomy 14 (solely)]]
 
−
: [[+15 or trisomy 15 (as sole autosomal abnormality)]]
 
−
: [[+16 or trisomy 16 (solely)]]
 
−
: [[+18 or trisomy 18 in lymphoproliferative disorders]]
 
−
: [[+20 or trisomy 20 (solely)]]
 
−
: [[+21 or trisomy 21]]
 
−
: [[+6 or trisomy 6]]
 
−
: [[+7 or trisomy 7 (solely)]]
 
−
: [[+8 or trisomy 8]]
 
−
: [[+9 or trisomy 9]]
 
−
: [[-21 or monosomy 21 (solely)]]
 
−
: [[-7/del(7q) in adults]]
 
−
: [[-7/del(7q) in childhood]]
 
−
: [[11q23 rearrangements (KMT2A) in leukaemia]]
 
−
: [[12p abnormalities in myeloid malignancies]]
 
−
: [[1q translocations (unbalanced) in myeloid malignancies]]
 
−
: [[1q triplication in hematologic malignancies]]
 
−
: [[3q26 rearrangements (MECOM) in myeloid malignancies]]
 
−
: [[Atypical Chronic Myeloid Leukemia (aCML)]]
 
−
: [[Childhood myelodysplastic syndromes]]
 
−
: [[Classification of myelodysplasic syndromes]]
 
−
: [[Congenital leukaemias]]
 
−
: [[Infant leukaemias]]
 
−
: [[Isolated tetrasomy 8 in AML, MDS and MPD]]
 
−
: [[MLL amplification in leukemia]]
 
−
: [[Monosomal karyotype (MK) in myeloid malignancies]]
 
−
: [[Neonatal leukaemias]]
 
−
: [[Refractory anemia (RA)]]
 
−
: [[Refractory anemia with excess blasts (RAEB)]]
 
−
: [[Refractory anemia with ringed sideroblasts (RARS)]]
 
−
: [[Trisomy 19]]
 
−
: [[Trisomy 2]]
 
−
: [[Y loss in leukemia]]
 
−
: [[del (3q)]]
 
−
: [[del (13q)]]
 
−
: [[del(13q) in myeloid malignancies]]
 
−
: [[del(16)(q22) CBFB/MYH11]]
 
−
: [[del(17p) in myeloid malignancies]]
 
−
: [[del(20q) in myeloid malignancies]]
 
−
: [[del(21)(q21q22) USP16/RUNX1]]
 
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: [[del(5q) in myeloid neoplasms]]
 
−
: [[del(9q) solely]]
 
−
: [[dic(17;20)(p11.2;q11.2)]]
 
−
: [[dic(1;15)(p11;p11)]]
 
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: [[i(17q) solely in myeloid malignancies]]
 
−
: [[i(5)(p10) in acute myeloid leukemia]]
 
−
: [[ider(20q) in Myeloid Malignancies]]
 
−
: [[idic(X)(q13)]]
 
−
: [[ins(3;3)(q26;q21q26) PSMD2/MECOM]]
 
−
: [[inv(11)(p15q22) NUP98/DDX10]]
 
−
: [[inv(11)(q21q23) KMT2A/MAML2 in therapy related leukemias]]
 
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: [[inv(6)(p15q13)]]
 
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: [[inv(6)(p25q13)]]
 
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: [[t(10;12)(q24;p13) ETV6/GOT1]]
 
−
: [[t(10;16)(q22;p13) KAT6B/CREBBP]]
 
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: [[t(11;11)(p15;q22) NUP98/DDX10]]
 
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: [[t(11;16)(q23;p13.3) KMT2A/CREBBP]]
 
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: [[t(11;17)(q23;q25) KMT2A/SEPT9]]
 
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: [[t(11;20)(p15;q11) NUP98/TOP1]]
 
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: [[t(12;12)(p13;q13) ETV6/BAZ2A]]
 
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: [[t(12;12)(p13;q13) HMGA2/?]]
 
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: [[t(12;13)(p12;q12-14) ETV6/CDX2]]
 
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: [[t(12;13)(p13;q14) LIN00598/ETV6]]
 
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: [[t(12;14)(q13;q31) HMGA2/?]]
 
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: [[t(12;17)(p13;p13) ETV6/PER1]]
 
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−
: [[t(12;20)(q15;q11.2) HMGA2 truncated]]
 
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: [[t(12;22)(p13;q12) MN1/ETV6]]
 
−
: [[t(14;21)(q22;q22) RUNX1/?]]
 
−
: [[t(15;21)(q22;q22) RUNX1/?]]
 
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: [[t(16;16)(p13;q22) CBFB/MYH11]]
 
−
: [[t(16;21)(q24;q22) RUNX1/CBFA2T3]]
 
−
: [[t(1;11)(p32;q23) KMT2A/EPS15]]
 
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: [[t(1;12)(p36;p13) ETV6/MDS2]]
 
−
: [[t(1;12)(q21;p13) ETV6/ARNT]]
 
−
: [[t(1;12)(q21;q24)]]
 
−
: [[t(1;16)(q11;q11)]]
 
−
: [[t(1;18)(q10;q10)]]
 
−
: [[t(1;19)(p13;p13.1)]]
 
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: [[t(1;2)(p36;p21) PRDM16 and LINC00982/?]]
 
−
: [[t(1;21)(p36;q22) RUNX1/PRDM16]]
 
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: [[t(5;11)(q31;q23) KMT2A/ARHGAP26]]
 
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: [[t(5;12)(q13;p13) ?/ETV6]]
 
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: [[t(5;12)(q31;p13) ETV6/ACSL6 in MDS,AML and AEL]]
 
−
: [[t(5;12)(q33;p13) ETV6/PDGFRB]]
 
−
: [[t(5;16)(q32;p13) NDE1/PDGFRB]]
 
−
: [[t(5;17)(q33;p11.2) SPECC1/PDGFRB]]
 
−
: [[t(5;17)(q33;p13) RABEP1/PDGFRB]]
 
−
: [[t(5;21)(q13;q22) RUNX1/?]]
 
−
: [[t(5;7)(q33;q11) HIP1/PDGFRB]]
 
−
: [[t(6;12)(p21;p13) CCND3/ETV6 in lymphoid malignancies]]
 
−
: [[t(6;20)(q13;q12) LMBRD1/CHD6]]
 
−
: [[t(6;21)(p22;q22) RUNX1-?]]
 
−
: [[t(6;8)(q27;p12) FGFR1OP/FGFR1]]
 
−
: [[t(6;9)(p22;q34) DEK/NUP214]]
 
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: [[t(7;12)(p12;q13) HMGA2 truncated]]
 
−
: [[t(7;12)(q36;p13) MNX1/ETV6]]
 
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: [[t(8;12)(q12;p13)]]
 
−
: [[t(8;12)(q22;q13) HMGA2/?]]
 
−
: [[t(8;13)(p11;q12) ZMYM2/FGFR1]]
 
−
: [[t(8;21)(q23;q22) RUNX1/ZFPM2]]
 
−
: [[t(8;9)(p22;p24) PCM1/JAK2]]
 
−
: [[t(9;12)(p24;p13) ETV6/JAK2]]
 
−
: [[t(9;12)(q22;p12) ETV6/SYK]]
 
−
: [[t(9;12)(q34;p13) ETV6/ABL1]]
 
−
: [[t(X;20)(q13;q13.3)]]
 
−
: [[t(Y;1)(q12;q12)]]
 
  
−
==Treatment Related Leukaemias (t-ANLL)==
+
{| class="wikitable"
 +
|+INVERSIONS
 +
|-
 +
|'''ANOMALY'''
 +
|'''ASSOCIATED DISORDERS with FISH test'''
 +
|'''GENES'''
 +
|-
 +
|[[inv(3)(q21q26.2) ]]
 +
|[[MDS]],[[ AML]]
 +
|[[RPN1-MECOM(EVI1)]]
 +
|-
 +
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==Duplications==
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: [[12p abnormalities in myeloid malignancies]]
 
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: [[21q22 rearrangements (RUNX1) in treatment related leukemia]]
 
−
: [[3q21q26 rearrangements (RPN1/MECOM) in treatment related leukemia]]
 
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: [[Biphenotypic Acute Leukaemia (BAL)]]
 
−
: [[Childhood myelodysplastic syndromes]]
 
−
: [[Classification of acute myeloid leukemias]]
 
−
: [[Classification of myelodysplasic syndromes]]
 
−
: [[MLL amplification in leukemia]]
 
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: [[11q23 rearrangements (KMT2A) in leukaemia]]
 
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: [[12p abnormalities in myeloid malignancies]]
 
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: [[15q13-15 Rearrangements]]
 
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: [[1q translocations (unbalanced) in myeloid malignancies]]
 
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: [[3q26 rearrangements (MECOM) in myeloid malignancies]]
 
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: [[Acute Erythroid leukaemias]]
 
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: [[Acute megakaryoblastic leukemia (AMegL)]]
 
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: [[Acute promyelocytic leukemia (APL)]]
 
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: [[Biphenotypic Acute Leukaemia (BAL)]]
 
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: [[Classification of acute myeloid leukemias]]
 
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: [[Congenital leukaemias]]
 
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: [[Infant leukaemias]]
 
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: [[Isolated tetrasomy 8 in AML, MDS and MPD]]
 
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: [[M0 acute non lymphocytic leukemia (M0-ANLL)]]
 
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: [[M3/M3v acute myeloid leukemia (AML M3/M3v)]]
 
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: [[M3/M3v acute non lymphocytic leukemia (M3-ANLL)]]
 
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: [[M7 acute non lymphocytic leukemia (M7-ANLL)]]
 
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: [[MLL amplification in leukemia]]
 
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: [[Monosomal karyotype (MK) in myeloid malignancies]]
 
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: [[Neonatal leukaemias]]
 
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==Non Hodgkin Lymphomas (NHL)==
 
  
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==Deletions==
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 +
|-
 +
|[[del(11)(q21q23)]]
 +
|[[AML]]
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|[[MLL]]
 +
|-
 +
|[[del(11)(q23) ]]
 +
|[[AML]],[[ B-ALL]],[[ CLL]],[[ MDS]],[[ NHL]]
 +
|[[MLL]]
 +
|-
 +
|[[add(12)(p)/ del(12)(p11.2p13)]]
 +
|[[AML]],[[ MDS]],[[ B-ALL]]
 +
|[[ETV6(TEL)]]
 +
|-
 +
|[[del(13)(q12q14) A B]]
 +
|[[AML]],[[ AMM]],[[ MDS]],[[ NHL]]
 +
 
 +
|-
 +
|[[del(13)(q12q22) A B]]
 +
|[[AML]],[[ PMF]],[[ CLL]],[[ MM]],[[ MDS]],[[ NHL]]
 +
|-
 +
|[[del(14)(q24) ]]
 +
|[[NHL]]
 +
|-
 +
|[[del(16)(q22) ]]
 +
|[[AML]],[[ AML-M4Eo]],[[ NHL]]
 +
 
 +
|-
 +
|[[del(17)(p11.2) A]]
 +
|[[B-ALL]],[[ AML]],[[ CLL]],[[  MDS]],[[ NHL]]
 +
|[[TP53(P53)]]
 +
|-
 +
|[[del(18)(q21)]]
 +
|[[AML]],[[ NHL]]
 +
 
 +
|-
 +
|[["del(20)(q11.2q13.1)
 +
del(20)(q11.2q13.3)"]]
 +
|[[AML]],[[ MDS]],[[ MPD]]
 +
|-
 +
|[[ider(20)(p11.1)del(20)(q11.2q13.3)]]
 +
|[[AML]],[[ MDS]],[[ MPD]]
 +
|[["
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|-
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|[[del(X)(q24)]]
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|[[NHL]]
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|}
 +
 
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==Numerical Abnormalities==
 +
 
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{| class="wikitable"
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|+NUMERICAL
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|'''ANOMALY'''
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|'''ASSOCIATED DISORDERS with FISH test'''
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|'''GENES'''
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|[[+3]]
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|[[SLVL]],[[ T-cell lymphoma]],[[ MZL]],[[ MCL]],[[ MALT]]
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|[[+4]]
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|[[AML M1-M2 and M4]],[[ and treatment related AML]]
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|[[+8]]
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|[[B-ALL]],[[ AML]],[[ MPD]],[[ MDS]],[[ PV]]
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|[[+9]]
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|[[AML]],[[ MDS]],[[ MPD]],[[ PV]],[[ B-ALL]],[[ T-ALL]]
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|[[+10]]
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|[[AML]],[[ B-ALL]],[[ MDS]]
 +
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 +
|[[+11]]
 +
|[[AML M1]],[[ M2]],[[ M4]],[[ MDS ]]
 +
|-
 +
|[[+12]]
 +
|[[AML]],[[ CLL]],[[ NHL]],[[ MALT]],[[ HCL]],[[ SLVL]],[[ WM/LPL]],[[ FL]],[[ MCL and DLBCL]]
 +
|-
 +
|[[+13/+13,+13]]
 +
|[[AML-M0]]
 +
|-
 +
|[[+14]]
 +
|[[MDS RA]],[[ RAEB±T mainly]],[[ AML M1]],[[ M2]],[[ M4]],[[ atypical MPD]]
 +
|-
 +
|[[+15]]
 +
|Age related when sole anomaly or with -Y
 +
|-
 +
|[[+19]]
 +
|[[AML]],[[ MDS]]
 +
|-
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|[[+21]]
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|[[AML]],[[ B-ALL]],[[ MDS]],[[ MPD]]
 +
|-
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|[[+22]]
 +
|[[AML-M4eo]]
 +
|-
 +
|[[-7  A B]]
 +
|[[MDS]],[[ RAEB/RAEB±T]],[[ CMML]],[[ J-CML]],[[ AML most often M4 or M6.]]
 +
|-
 +
|[[-Y ]]
 +
|age related when sole anomaly
  
−
==Other==
+
|}
  
−
: [[Castleman's disease]]
+
==Primarily Pediatric==
 +
 
 +
{| class="wikitable"
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|+PEDIATRIC
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|-
 +
|'''ANOMALY'''
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|'''ASSOCIATED DISORDERS with FISH test'''
 +
|'''GENES'''
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|-
 +
|[[t(1;19)(q23;p13.3)]]
 +
|[[B-ALL]]
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|[[PBX1-TCF3(E2A)]]
 +
|-
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|[[der(19)t(1;19)(q23;p13.3)]]
 +
|[[B-ALL]]
 +
|[[PBX1-TCF3(E2A)]]
 +
|-
 +
|[[t(8;14)(q11;q32)]]
 +
|[[B-ALL]]
 +
|[[CEBPD-IGH]]
 +
|-
 +
|[[i(9)(q10)/idic(9)(q10)]]
 +
|[[B-ALL]]
 +
|-
 +
|[[dic(9;12)(p11;p11.2)]]
 +
|[[B-ALL]]
 +
|-
 +
|[[dic(9;20)(p11;q11)]]
 +
|[[B-ALL]]
 +
|[[PAX5]]
 +
|-
 +
|[[t(17;19)(q22;p13)]]
 +
|[[B-ALL]]
 +
|[[TCF3(E2A)-HLF]]
 +
|-
 +
|[[t(1;22)(p13;q13)]]
 +
|[[AML M7]]
 +
|[[RBM15-MKL1]]
 +
|-
 +
|[[t(10;11)(p13;q23) ]]
 +
|[[Primarily AML ]],[[ uncommonly B-ALL]]
 +
|[[MLLT10(AF10)/MLL]]
 +
|-
 +
|[[t(16;21)(p11.2;q22)]]
 +
|[[AML]]
 +
|[[FUS-ERG]]
 +
|-
 +
|[[t(16;21)(q24;q22)]]
 +
|[[AML]]
 +
|[[CBFA2T3-RUNX1-(AML1)]]
 +
|-
 +
|[[t(10;11)(p13;q14)]]
 +
|[[T-ALL]]
 +
|[[MLLT10(AF10)/PICALM ]]
 +
|-
 +
|[[t(11;14)(p15;q11.2)]]
 +
|[[T-ALL]]
 +
|[[LMO1-TRA]]
 +
|-
 +
|[[t(11;14)(p13;q11-q11.2) ]]
 +
|[[T-ALL]]
 +
|[[LMO2(Rhom2)-TRA]]
 +
 
 +
|}

Revision as of 11:11, 3 September 2015

Translocations

Translocations
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
der(1)t(1;1)(p36;q21) NHL
t(1;3)(p36;q21) MDS,AML PRDM16(MEL1)-RPN1
t(1;3;5)(p36;p21;q33) CEL WDR48-PDGFRB
t(1;5)(q21;q33) MPD TPM3-PDGFRB 
t(1;5)(q22;q33) MPD with eosinophilia,CEL,B-ALL PDE4DIP-PDGFRB
der(1;7)(q10;p10) MDS,AML,MPD
t(1;8)(p13;q24.1) Missing MYC(C-MYC)
t(1;14)(q21;q32) A B C D B-ALL,NHL BCL9-IGH,FCGR2B-IGH,FCRL4-IGH,MUC1/IGH
t(1;19)(q23;p13.3) B-ALL PBX1-TCF3(E2A)
der(1;22)(q10;p10)
t(2;5)(p23;q35) ALCL,NHL ALK-NPM1
t(2;8)(p12;q24.1) BL,B-ALL,NHL MYC(C-MYC)
t(2;11)(p21;q23) MDS,AML,B-ALL MLL
t(2;14)(p15;q32) CLL,NHL,B-ALL,T-ALL,AML
t(3;3)(q21;q26.2) MDS,AML RPN1-MECOM(EVI1)
t(3;5)(p21-25;q32-35) MPD GOLGA4-PDGFRB 
t(3;21)(q26.2;q22) A t-AML,t-MDS RPL22(EAP)-RUNX1(AML1)
t(4;11)(q21;q23) B-ALL,T-ALL AFF1(AF4)-MLL
t(4;14)(p16.3;q32) MM FGFR3-IGH
t(4;22)(q12;q11) atypical MPD PDGFRA -BCR
t(4;5;5)(q23;q31;q33) chronic basophilic leukemia PRKG2-PDGFRB
t(5;7)(q33;q11.2) CMML HIP1-PDGFRB
t(5;10)(q33;q21) atypical MPD CCD6-PDGFRB
t(5;12)(q31;p13) CEL,MPD ETV6(TEL)-ACSL6
t(5;12)(q33;q24) MPD with eosinophilia   GIT2-PDGFRB
t(5;12)(q33;p13) CMML,MDS,MPD ETV6(TEL)-PDGFRB
t(5;14)(q33;q24) MPD,atypical MPD NIN-PDGFRB
t(5;14)(q33;q32) CCDC88C(KIAA1509)-PDGFRB
t(5;15)(q33;q22) CMML atypical MPD TP53BP1-PDGFRB
t(5;14)(q35;q32) T-cell lymphoma TLX3(HOX11L2)-BCL11B
t(5;16)(q33;q22) AML CBFB
der(5;17)(p10;q10) MDS,AML NPM1(NPM)-RARA
t(5;17)(q33;p11.2) JMML SPECC1-PDGFRB
t(5;17)(q33;p13) CMML,atypical MPD RABEP1-PDGFRB 
der(6)t(1;6)(q21;p21.3) PMF
t(6;9)(p23;q34) MDS,AML DEK-NUP214 (CAN)
t(6;11)(q27;q23) AML,t-AML,T-ALL MLLT4(AF6)-MLL
t(7;11)(p15;p15) AML NUP98-HOXA9
t(8;14)(q24.1;q32) BL,B-ALL,NHL MYC(C-MYC)- IGH
t(8;16)(p11.2;p13.3) A AML M4,M5a,M5b,t-MDS KAT6A(MYST3)-CREBBP(CBP)
t(8;21)(q22;q22) A AML M2 mostly,rarely M1,M4 RUNX1(AML)-RUNX1T1(ETO)
t(8;22)(q24.1;q11.2) BL,B-ALL,NHL,MM MYC(C-MYC)-IGL(IGL)
add(9)(p24) JAK2
t(9;11)(p22;q23) AML mostly M5,M4,B-ALL MLLT3(AF9)-MLL
t(9;14)(p13;q32) MM,CLL,DLBCL,FL,MCL splenic MZL PAX5-IGH
t(9;22)(q34;q11.2) A B CML,B-ALL,T-ALL ABL1(ABL)-BCR
t(11;14)(q13;q32) A MCL,MM CCND1(BCL1)- IGH
t(11;14)(q23;q32) t-AML MLL-KIAA0284
t(11;16)(q23;p13.3) t-MDS,t-AML MLL-CREBBP(CBP)
t(11;17)(q23;q21) APL ZBTB16(PLZF)-RARA
t(11;18)(q21;q21) MALT BIRC3(API2)-MALT1
t(11;19)(q23;p13.1) AML MLL-ELL
t(11;19)(q23;p13.3) B-ALL,AML,T-ALL MLL-MLLT1(ENL)
t(14;16)(q32;q23) MM IGH-MAF
t(14;18)(q32;q21) BL,DLBCL,FL,CLL IGH-BCL2
t(14;19)(q32;q13.3) CLL,DLBCL,MCL,MZL,SLVL
t(14;22)(q32;q11.2) B-ALL,CLL,HCL,AML,NHL,DLBCL IGH-IGL
t(15;17)(q24;q21) APL PML-RARA
t(16;16)(p13.1;q22) AML M4Eo MYH11-CBFB
der(19)t(1;19)(q23;p13.3) B-ALL,L3-like ALL,T-ALL,NHL,AML PBX1-TCF3(E2A)
der(Y)t(Y;1)(q12;q12) MDS


Inversions

INVERSIONS
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
inv(3)(q21q26.2) MDS,AML RPN1-MECOM(EVI1)
inv(11)(q21q23) MDS,AML M2,T-ALL MAML2-MLL
inv(14)(q11.2q32) PLL TRA-TCL1A(TCL1)
inv(16)(p13.1q22) AML M4Eo MYH11,CBFB

Duplications

DUPLICATIONS
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
dup(1)(q11q44)
dup(1)(q21q32) B-ALL,NHL
dup(1)(q21q42)
dup(1)(q23q32)
dup(1)(q23q42) NHL
dup(11)(q13q25) NHL MLL
dup(12)(q13q22)


Isochromsomes

ISOCHROMOSOMES
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
i(1)(q10) NHL
i(3)(q10) NHL
i(7)(q10) T-cell lymphoma
i(8)(q10) T-PLL,AML,B-ALL
i(11)(q10) AML M2,M4,MDS
i(17)(q10) MDS,MPD,AML,CML,B-ALL,CLL,Hodgkin and NHL
i(21)(q10) B-ALL,MDS,NHL,AML,CMML
idic(X)(q13) AML M1,M2,M4,MDS,RARS XIST

Cryptic

CRYPTIC
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
t(12;21)(p13;q22) B-ALL ETV6 (TEL)-RUNX1(AML1)
t(X;14) B-ALL CRLF2-IGH
t(Y;14) B-ALL CRLF2-IGH
t(5;14)(q35;q32) T-ALL TLX3-BCL11B
del(1)(p32p32) B-ALL TAL1-STIL


Deletions

DELETIONS
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
del(1)(p32p36) NHL,MM
del(1)(p32-34p36.1)
del(1)(p36.1) Neuroblastoma TP73(P73)
del(3)(p13p21)
del(3)(q21) B-ALL,AML,NHL
del(5)(q13q33) AML,MDS,MPD  PDGFRB
del(5)(q15q33) AML,MDS,MPD  PDGFRB 
del(5)(q22q35) AML,MDS,MPD  PDGFRB 
del(5)(q31q35) AML,MDS,MPD  PDGFRB 
del(6)(q13q21) WM/LPL,MM,NK lymphoma,DLBCL BLMP1-PRDM1
del(6)(q13q23) A CLL,atypical CLL,FL,MCL,T-NHL,childhood B-ALL,childhood T-ALL,adult ALL,MM
del(6)(q15q21)
del(6)(q21) A CLL,atypical CLL,AML,childhood B-ALL,childhood T-ALL,adult ALL,MM
del(7)(p15)
del(7)(p13) AML,NHL
del(7)(p13p15)
del(7)(p11.2) B-ALL,AML,MDS
del(7)(q11.2) B-ALL,AML,MDS
del(7)(q22q34) A AML,MDS,NHL
del(7)(q32q34) A AML,MDS,NHL
del(7)(q32) A AML,MDS,NHL
del(8)(p21)
del(8)(q22)
del(9)(p13) B-ALL,NHL,pediatric B-ALL
del(9)(p13p22) B-ALL
del(9)(p21) B-ALL,AML,NHL
del(9)(p22) B-ALL
del(9)(q13) AML M1,M2,M4,M6
del(9)(q13q22) AML,MDS
del(10)(q24)
del(11)(p11.2) NHL
del(11)(p12p13) B-ALL LMO2
del(11)(q13) Missing
del(11)(q13q21) Missing
del(11)(q13q23) AML,CLL,MDS,NHL ATM
del(11)(q21q23) AML MLL
del(11)(q23) AML,B-ALL,CLL,MDS,NHL MLL
add(12)(p)/ del(12)(p11.2p13) AML,MDS,B-ALL ETV6(TEL)
del(13)(q12q14) A B AML,AMM,MDS,NHL
del(13)(q12q22) A B AML,PMF,CLL,MM,MDS,NHL
del(14)(q24) NHL
del(16)(q22) AML,AML-M4Eo,NHL
del(17)(p11.2) A B-ALL,AML,CLL,MDS,NHL TP53(P53)
del(18)(q21) AML,NHL
[["del(20)(q11.2q13.1)

del(20)(q11.2q13.3)"]]

AML,MDS,MPD
ider(20)(p11.1)del(20)(q11.2q13.3) AML,MDS,MPD [["
del(X)(q24) NHL

Numerical Abnormalities

NUMERICAL
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
+3 SLVL,T-cell lymphoma,MZL,MCL,MALT
+4 AML M1-M2 and M4,and treatment related AML
+8 B-ALL,AML,MPD,MDS,PV
+9 AML,MDS,MPD,PV,B-ALL,T-ALL
+10 AML,B-ALL,MDS
+11 AML M1,M2,M4,MDS
+12 AML,CLL,NHL,MALT,HCL,SLVL,WM/LPL,FL,MCL and DLBCL
+13/+13,+13 AML-M0
+14 MDS RA,RAEB±T mainly,AML M1,M2,M4,atypical MPD
+15 Age related when sole anomaly or with -Y
+19 AML,MDS
+21 AML,B-ALL,MDS,MPD
+22 AML-M4eo
-7 A B MDS,RAEB/RAEB±T,CMML,J-CML,AML most often M4 or M6.
-Y age related when sole anomaly

Primarily Pediatric

PEDIATRIC
ANOMALY ASSOCIATED DISORDERS with FISH test GENES
t(1;19)(q23;p13.3) B-ALL PBX1-TCF3(E2A)
der(19)t(1;19)(q23;p13.3) B-ALL PBX1-TCF3(E2A)
t(8;14)(q11;q32) B-ALL CEBPD-IGH
i(9)(q10)/idic(9)(q10) B-ALL
dic(9;12)(p11;p11.2) B-ALL
dic(9;20)(p11;q11) B-ALL PAX5
t(17;19)(q22;p13) B-ALL TCF3(E2A)-HLF
t(1;22)(p13;q13) AML M7 RBM15-MKL1
t(10;11)(p13;q23) Primarily AML ,uncommonly B-ALL MLLT10(AF10)/MLL
t(16;21)(p11.2;q22) AML FUS-ERG
t(16;21)(q24;q22) AML CBFA2T3-RUNX1-(AML1)
t(10;11)(p13;q14) T-ALL MLLT10(AF10)/PICALM 
t(11;14)(p15;q11.2) T-ALL LMO1-TRA
t(11;14)(p13;q11-q11.2) T-ALL LMO2(Rhom2)-TRA
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